Vendredi 20 septembre 2024

L'Intégration de l'IA dans la Bioinformatique de la Séquence : Révolutionner l'Analyse de l'ADN/ARN.

L'intégration de l'intelligence artificielle (IA) dans la bioinformatique transforme l'analyse des séquences d'ADN et d'ARN, rendant les processus plus rapides, plus précis, et ouvrant la voie à des découvertes révolutionnaires en génomique. Cette convergence de l'IA et de la bioinformatique, souvent appelée "IA bioinformatique", permet de traiter les quantités massives de données générées par les technologies de séquençage à haut débit, tout en offrant des perspectives inédites sur la fonction et l'évolution des génomes...

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Vendredi 23 août 2024

Le Microbiome : Révolutionner la Santé Humaine, Animale et l'Industrie Alimentaire grâce à la Bioinformatique

Le microbiome, constitué de trillions de micro-organismes tels que les bactéries, les virus, les champignons et les archées, est un acteur clé dans les processus biologiques de divers environnements. Qu'il s'agisse de l'intestin humain, de la flore intestinale des animaux, ou des écosystèmes microbiens présents dans les aliments, ces communautés microscopiques influencent la santé, le bien-être et la productivité à des niveaux profonds et souvent insoupçonnés...

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Vendredi 9 décembre 2022

Biomanda renouvelle son agrément CIR

Notre société Biomanda a reçu son renouvellement comme organisme de recherche privé agréé CIR (Crédit Impôt Recherche) auprès du Ministère de la Recherche Française pour les années 2023 à 2027.

Contactez-nous pour vos besoins en bioinformatique, en particulier dans nos domaines de prédilection : conception de système de détection d'organismes, étude de biodiversité nouvelle génération et data-mining en biologie.

Lundi 07 mars 2022

Covid-19, le point de vue d’un phylogénéticien

Le SARS-cov-2 a changé nos vies et nos sociétés. Après deux ans de pandémie, nous vous proposons le ressenti de notre fondateur, phylogénéticien des microbes et des virus.

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Vendredi 19 mars 2021

Hommage au Pr. Richard Christen

C'est avec une immense tristesse que nous vous faisons part du décès du Pr. Richard Christen. Il fut un brillant scientifique, passionné par son métier, le décryptage de l'ADN et l'analyse du monde microbien.
Son ancienne équipe tient à lui rendre un dernier hommage solennel.
Adieux Richard, tu nous manqueras.
Claude, Olivier, Dipankar, Ronnie & Julien.

Jeudi 07 mai 2020

Evolutionary study of covid-19 strains and their close relatives

Humanity is currently facing a major health crisis whose political, economic and social repercussions are likely to be long and serious. However, our species has known in the distant past, a much more serious pandemic, the black plague, which led to the extinction of 2/3 of the European population. Our technological level and our knowledge allow us today to face, if they are used in an optimal way of course. The post-world will have to understand that against natural crises, the solutions will always come from R&D and knowledge. The better we know and the better we will master the next challenges we will face. To do this, we will have to make choices about the use of our financial resources and prioritize the essential over the entertainment. In order to shed light on the situation of Covid-19, we performed a phylogenetic analysis of the strains of covid-19 and their close relatives available in scientific databases.

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Jeudi 07 mai 2020

Evolutionary study of covid-19 strains and their close relatives

Humanity is currently facing a major health crisis whose political, economic and social repercussions are likely to be long and serious. However, our species has known in the distant past, a much more serious pandemic, the black plague, which led to the extinction of 2/3 of the European population. Our technological level and our knowledge allow us today to face, if they are used in an optimal way of course. The post-world will have to understand that against natural crises, the solutions will always come from R&D and knowledge. The better we know and the better we will master the next challenges we will face. To do this, we will have to make choices about the use of our financial resources and prioritize the essential over the entertainment. In order to shed light on the situation of Covid-19, we performed a phylogenetic analysis of the strains of covid-19 and their close relatives available in scientific databases.

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Lundi 02 décembre 2019

Démarrage d'un projet de recherche sur l'autisme

Aujourd'hui les connaissances sur la population autiste ont beaucoup progressé. Il est largement accepté que ces caractéristiques sont principalement portées par des critères génétiques, même si une part de facteurs environnementaux in utero peut intervenir dans cette maturation cérébrale atypique. Parce que l'identification d'une frange de cette population demeure complexe à l'âge de 1 à 2 ans, nous souhaitons développer une méthode de caractérisation génétique basée sur le séquençage complet du génome humain.

Vendredi 29 novembre 2019

Biomanda renouvelle son agrément CIR

Notre société Biomanda a reçu son renouvellement comme organisme de recherche privé agréé CIR (Crédit Impôt Recherche) auprès du Ministère de la Recherche Française pour les années 2020 à 2022.

Contactez-nous pour vos besoins en bioinformatique, en particulier dans nos domaines de prédilection : conception de système de détection d'organismes, étude de biodiversité nouvelle génération et data-mining en biologie.

Lundi 30 septembre 2019

Invitation à la formation de l'Ecole Doctorale de Toulon

Dans le cadre de notre partenariat avec Réseau Entreprendre, nous avons été sollicités pour présenter notre retour d'expérience sur la création d'entreprise et le projet Biomanda. Je remercie Christophe Boureau et Anna Cipière pour cette invitation aux Doctoriales.

Lundi 10 juin 2019

Acquisition d'un nouveau serveur de calcul

Après 5 ans d'activité, nous agrandissons notre parc informatique avec un nouveau serveur de calcul dédié à nos besoins de R&D. D'une capacité de 20 coeurs et de 128 GB de RAM, il nous permettra de générer des bases de données de référence de haute qualité, qui sont indispensables dans le traitement des demandes de nos clients. Le système fonctionne sous Ubuntu 18.04 LTS, une OS très polyvalente pour les calculs scientifiques et adaptée au respect des règles de qualité des entreprises.

Mercredi 19 décembre 2018

Bonnes fêtes de fin d'année

Nous vous souhaitons d'excellentes fêtes de fin d'année et plein de succès pour cette nouvelle année 2019 qui arrive. Nous remercions l'ensemble de nos clients pour leur confiance !

Lundi 17 septembre 2018

Génome coeur et génome accessoire

Depuis les années 2010 et l'amélioration des méthodes de séquençage, la génomique est en plein essor. L'acquisition des nouvelles données de génétique a permis de mieux comprendre les fonctions biologiques, de découvrir de nombreux gènes et de nouvelles structures génétiques mais également de mettre en évidence des incohérences entre la génétique et la classification taxonomique traditionnelle. Ainsi une nouvelle notion a été introduite : le génome coeur et le génome accessoire.

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Jeudi 28 juin 2018

La métagénomique et la métagénétique

La métagénomique est l'étude de l'ensemble des informations génétiques contenues dans un environnement (d'où le préfixe grec méta). L'ADN environnemental est tout d'abord extrait puis séquencé pour être analysé. Elle se différencie de la métagénétique qui permet l'identification des taxons présents dans un échantillon. Ici un marqueur génétique est ciblé au sein de l'ADN environnemental pour être séquencé et associé à un taxon référent....

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Mercredi 07 mars 2018

Les applications de la génomique en agroalimentaire

On appelle génome, l'ensemble des molécules d'ADN d'une cellule. Ces molécules peuvent être de natures différentes : chromosome, plasmide et structure virale au sens large. La compréhension et l'analyse des génomes, la génomique, permet de lister l'ensemble des fonctions biologiques d'un organisme et de réaliser des études phylogénétiques complexes. La génomique et la bioinformatique ont plusieurs applications dans le domaine de l'agro-alimentaire...

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Mardi 20 décembre 2017

La métagénomique : applications et perspectives

La métagénomique est une méthode qui consiste à décrypter l'intégralité des génomes contenus dans un environnement. Cette approche est le Saint-Graal du biologiste et permettra d'explorer de la manière la plus exhaustive et la plus complète l'univers microbien et viral d'un échantillon

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Mardi 05 septembre 2017

Prediction of miRNA-disease Associations using an Evolutionary Tuned Latent Semantic Analysis

MicroRNAs, small non-coding elements implied in gene regulation, are very interesting biomarkers for various diseases such as cancers. They represent potential prodigious biotechnologies for early diagnosis and gene therapies. However, experimental verification of microRNA-disease associations are time-consuming and costly, so that computational modeling is a proper solution. Previously, we designed MiRAI, a predictive method based on distributional semantics, to identify new associations between microRNA molecules and human diseases. Our preliminary results showed very good prediction scores compared to other available methods...

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Lundi 03 juillet 2017

Biomanda renouvelle son agrément CIR

Notre société Biomanda a reçu son renouvellement comme organisme de recherche privé agréé CIR (Crédit Impôt Recherche) auprès du Ministère de la Recherche Française pour les années 2017 à 2019.

Contactez-nous pour vos besoins en bioinformatique, en particulier dans nos domaines de prédilection : conception de système de détection d'organismes, étude de biodiversité nouvelle génération et data-mining en biologie.

Mercredi 21 juin 2017

Une nouvelle page web pour le projet MiRAI

Le projet MiRAI a encore passé une étape dans la précision de prédictions avec l'utilisation d'algorithmes évolutionnistes. La contribution du spécialiste Denis Pallez, qui a rejoint l'aventure en 2016, a permis une amélioration du paramétrage de MiRAI avec une progression de 32%.

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Jeudi 11 mai 2017

After-Work Réseau Entreprendre Var - C2CARE

Nous remercions Romain Streichemberger et Pierre Gadea pour nous avoir fait découvrir leur société et leur technologie de réalité virtuelle appliquée à la médecine.

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Vendredi 17 mars 2017

La place de la génomique dans la médecine de demain

La génomique est un domaine de la biologie qui consiste en l’étude du génome (l’information génétique) complet d’un organisme. Son objectif est de lire l’intégralité de cette information puis de la décoder pour en percer ses fonctionnements. Elle est appliquée en microbiologie pour comprendre par exemple la pathogénicité d’une souche ou en agronomie dans le cadre de l’amélioration des espèces domestiquées. Chez l’Humain, il existe de nombreuses applications tant en médecine, en histoire, en sciences humaines ou encore dans le domaine de la justice.

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Vendredi 17 février 2017

Fin d'accompagnement avec Réseau Entreprendre

Nous remercions chaleureusement l'équipe Var de Réseau Entreprendre, Christophe et Cindy, pour leur accompagnement et leur suivi de notre projet d'entreprise. Les clubs lauréats étaient un excellent moment de partage autour des problèmes centraux du chef d'entreprise mais également la possibilité de découvrir d'autres activités industrielles (métallurgie, journalisme, énergie, tourisme, ébenisterie, etc.).

Jeudi 19 janvier 2017

Les nouvelles formules de formation Biomanda

Découvrez nos nouvelles formations intra-enrteprises de 2017. Nous mettons également en place cette année des journées de formation inter-entreprises en bioinformatique et en "omics" dans plusieurs villes de France. Consultez notre site pour plus de détails.

Plus d’informations sur nos offres : Nos formations

Lundi 19 décembre 2016

L'équipe de Biomanda vous souhaite de bonnes fêtes !

L'année 2016 se termine déjà. Malgré les évènements funestes qui ont frappé notre pays, nous voulons garder l'espoir et l'optimisme qui caractérisent les start-ups ! Nous vous souhaitons de très bonnes fêtes de fin d'années en famille et tous nos voeux de bonheur pour cette nouvelle année 2017 !

Jeudi 24 novembre 2016

Le projet de recherche sur les micro-ARNs continue en 2017

Après les succès de la première campagne de recherche, nous poursuivons les efforts autour de la prédictions d'associations chez les micro-ARNs. Le projet est en collaboration avec l'équipe du Dr. Claude Pasquier de l'I3S à Sophia Antipolis.

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Mardi 27 septembre 2016

Genomics: Best combinations between wet and dry biology

With the advances of next generation sequencing, bacterial genomics is currently booming. It allows exploring the genetic diversity of isolates from a bacterial population, identifying characteristic functions of pan genomes and doing microbial source tracking. ...

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Mardi 30 août 2016

L'origine des virus

Intéressante publication de Harish et al. sur l'origine des virus d'après les scénarii de Wessner et al. de 2010. Le travail présente la problématique de la robustesse des constructions phylogénétiques et du racinement d'une récente publication sur le sujet.

Harish A, Abroi A, Gough J, Kurland C. (2016) Did Viruses Evolve As a Distinct Supergroup from Common Ancestors of Cells? Genome Biol Evol. 8(8):2474-81. doi: 10.1093/gbe/evw175.

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Mardi 19 juillet 2016

Club des incubés

Excellente soirée d'échanges autour des problématiques de la création d'entreprises en France et de la vie de la startup. Retour d'expériences des chefs d'entreprises Jean Riondel (MiniGreenPower) et Edouard Le Goff (Kinaxia).

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Lundi 11 juillet 2016

Biorézo "Les entreprises du 06 ont l’innovation dans la peau !"

Réunion du pôle Eurobiomed sur les innovations dans le domaine de la peau. Au programme : tissue engineering, analyse d'images médicales pour l'aide à la décision dans le diagnostic, consultations à distance et les pansements nouvelles générations.

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Mardi 05 juillet 2016

Rencontres Franco-chinoises à Sophia Antipolis

Nous avons participé aux rencontres entre la délégation chinoise de la région de Chengdu et les entreprises françaises organisées par le réseau Entreprise Europe Network. Ce fut l'occasion de rencontrer plusieurs sociétés de biotechnologie chinoises et de réaliser d'intéressantes discussions autour des nouveaux besoins en biologie.

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Jeudi 02 juin 2016

Prediction of miRNA-disease associations with a vector space model

MicroRNAs play critical roles in many physiological processes. Their dysregulations are also closely related to the development and progression of various human diseases, including cancer. Therefore, identifying new microRNAs that are associated with diseases contributes to a better understanding of pathogenicity mechanisms. MicroRNAs also represent a tremendous opportunity in biotechnology for early diagnosis. To date, several in silico methods have been developed to address the issue of microRNA-disease association prediction. However, these methods have various limitations. In this study, we investigate...

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Lundi 14 décembre 2015

Les 5 ans de la fondation Unice

Nous étions invités à la soirée célébrant les 5 ans de la Fondation UNICE dans les locaux de Nice Matin. Les 5 axes d'actions de la Fondation ont permis de soutenir l'égalité des chances, des projets de recherche porteurs (Alzheimer, cancer, hydro-informatique, etc.), des projets sur le patrimoine, la création d'entreprises (dont nous avons bénéficié) et même une comédie musicale ! De nombreuses surprises ont eu lieu au cours de la soirée avec la mise en avant du Tutorat des étudiants de médecine de Nice et les excellents résultats à l'ECN de l'université de Nice.

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Lundi 5 octobre 2015

Biomanda fête ses 2 ans !

Cela fait deux ans aujourd'hui que Biomanda accompagne les entreprises et les instituts publics dans leurs problématiques biologiques en proposant des solutions bioinformatiques innovantes et personnalisées. Nous remercions les personnes qui ont apporté leur soutien à notre structure depuis sa création ainsi que l'ensemble de nos clients qui ont su nous faire confiance. L'année 2016 sera pour Biomanda l'année du lancement de Biomanda Search, un outil intelligent de veille technologique qui recherche ce dont vous avez besoin dans la littérature scientifique.

Jeudi 1 octobre 2015

"Au coeur de la bioinformatique", Métropole Var

Biomanda a eu l'honneur de figurer dans le 200ème numéro de Métropole Var dans la catégorie des 100 varois qui feront demain. Nous remercions Olivier Stéphan et son équipe de nous avoir convié à leur soirée d'anniversaire pour fêter ce cap important dans la vie d'un magazine. Nous leur souhaitons toute la réussite que mérite leur implication dans la recherche de l'information.

En savoir plus : Voir l'article

Lundi 27 juillet 2015

Les bactériophages, fléaux ou opportunités ?

Les bactériophages sont des virus dont le tropisme est orienté sur les Bactéries ou les Archaea. Il représente un ensemble d’espèces très diversifié puisqu’à l’état actuel des connaissances, plusieurs espèces de phages ont été répertoriées pour une même espèce de bactérie. Les phages sont divisés en 18 familles : ...

Pour plus d'information : Voir l'article

Lundi 29 juin 2015

Pourquoi et à quand recourir à des services de bioinformatique ?

L'avènement de la biologie moléculaire a généré de nouveaux besoins et de nouvelles contraintes en biologie (stockage de données, modélisation, analyse de données massives, etc.). Pour répondre à ces défis caractéristiques de la biologie, le domaine de la bioinformatique s'est organisé et développé autour de quatre compétences...

Pour plus d'information : Voir l'article

Mardi 16 juin 2015

Les probiotiques, les technologies ADN et la bioinformatique

Prendre soin de sa santé en mangeant des produits du quotidien, c'est le nouveau défi du secteur de l'agroalimentaire. Les probiotiques (des micro-organismes) exercent des effets positifs sur notre santé lorsque ces derniers sont présents en quantité suffisante dans notre alimentation. Ils peuvent améliorer le transit, stimuler le système immunitaire, voire prévenir de certaines maladies. La biologie moléculaire et la bioinformatique sont de puissants outils pour les phases de recherche et d'innovation sur les probiotiques...

Plus d'informations sur Les probiotiques

Lundi 1 juin 2015

« L’expert en bio-informatique nouvelle génération »

Actuellement en phase de transition technologique, la biologie traditionnelle (descriptive) fait place, de plus en plus, à la biologie moléculaire (basée sur l’ADN). Une évolution significative qui a fait apparaître, il y a quelques années, la bioinformatique et qui a poussé Julien Gardès à fonder Biomanda à Sophia Antipolis en 2013.

Plus d’informations : Lire l’article de Select Sophia

Mardi 12 mai 2015

Biomanda, centre de formation

Depuis le 1er mai, la société Biomanda est désormais enregistrée sous le numéro 93.06.07568.06 auprès du préfet de région Provence-Alpes-Côte d’Azur. Cet enregistrement ne vaut pas agrément de l’Etat. Nous proposons des formations sur l’initiation à la bioinformatique et l’évolution des méthodes de biologie moléculaire pour accompagner les équipes de laboratoire dans leurs transitions technologiques.

Plus d’informations sur nos offres : Nos formations

Jeudi 23 avril 2015

Biomanda rejoint le pôle Terralia

Dans le cadre de sa stratégie de développement dans le secteur de l’agroalimentaire, Biomanda est devenue membre du réseau Terralia. Notre société apportera au pôle ses compétences dans les domaines émergents des technologies ADN et de la bioinformatique pour répondre aux nouvelles problématiques de la filière (contaminants, qualité, R&D, probiotiques, etc.).

Plus de renseignements : En savoir plus

Jeudi 12 mars 2015

Interview par Les Petites Affiches

Coup pouce jeunes pousses #4 : BIOMANDA

Plus de renseignements : http://www.petites-affiches.fr

Mardi 17 février 2015

Biomanda, lauréat de Réseau Entreprendre

Biomanda a été sélectionnée par les membres du Réseau Entreprendre du Var pour bénéficier du support de l'association.

Vendredi 16 janvier 2015

La métagénétique, le nouvel horizon du monitoring microbien

Lire l'article

Vendredi 5 decembre 2014

Tests de diagnostic in vitro & émergents

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Vendredi 24 octobre 2014

Résumé des actualités d'octobre 2014

Premier cas d'infection par Salmonella enterica Serovar Typhi produisant de l'ESBL sur le continent Américain.
Epidémie de Choléra en Birmanie.
Relation entre risque épidémique du Choléra et les facteurs environnementaux, climatiques et démographiques.
Etat des lieux sur l'épidémie Ebola au Congo.

Lire l'article

Vendredi 10 octobre 2014

Seaview, le couteau-suisse de la Bioinformatique !

Biomanda vous propose de découvrir Seaview, un logiciel de manipulation de séquences généraliste, simple et efficace.

Lire l'article

Du 1er au 4 septembre 2014

Biomanda participe à Food Micro 2014

La société Biomanda participera à l'évènement Food Micro 2014 à Nantes et présentera un poster sur l'évaluation des amorces PCR servant à détecter Vibrio cholerae. L'étude recouvre les publications depuis les années 80 jusqu'à aujourd'hui.

Plus d'informations: www.foodmicro2014.org

Mardi 17 juin 2014

Biomanda participe à Biorezo

La société Biomanda participera à l'évènement Biorezo du pôle de compétitivité Eurobiomed dans les locaux de TxCell à Sophia Antipolis. Au cours de cette soirée, TxCell présentera son expérience : l’introduction en bourse réussie d’un business model d’immunothérapie cellulaire personnalisée économiquement viable. Nous aurons également l'occasion de réaliser une présentation de nos activités.

Plus d'informations: www.investincotedazur.com

Mardi 10 juin 2014

Biomanda obtient son agrément CIR

La société Biomanda est désormais un organisme de recherche privé agréé CIR (Crédit Impôt Recherche) auprès du Ministère de la Recherche Française pour les années 2014 à 2016.

Contactez-nous pour vos besoins en bioinformatique, en particulier dans nos domaines de prédilection : vérification/amélioration/conception de système de détection d'organismes, étude de biodiversité nouvelle génération et data-mining en biologie.

Jeudi 22 mai 2014

Biomanda, Jeune Entreprise Innovante

La société Biomanda a obtenu son attestation Jeune Entreprise Innovante par le Ministère de la Recherche Française.

Jeudi 22 mai 2014

Interview par Team Côte d'Azur

Pourquoi Biomanda, start-up dédiée à la bioinformatique, a choisi Sophia Antipolis ?
La start-up Biomanda démarre à Sophia Antipolis une activité de bioinformatique dédiée aux activités de Biologie, Agroalimentaire, Santé, Vétérinaire, Environnement et Cosmétologie

Plus de renseignements : www.investincotedazur.com

Mercredi 21 et Jeudi 22 mai 2014

Biomanda participe à Hydrogaïa

Venez-nous rencontrer sur le salon Hydrogaïa à Montpellier le mercredi 21 et jeudi 22 mai 2014. Anticipez un rendez-vous grâce à la plateforme Pro'Hydro.

Plus de renseignements : Pro'Hydro

Vendredi 14 mars 2014

Biomanda, membre du pôle de compétitivité Pôle Eau

Biomanda est membre du pôle de compétitivité Pôle Eau.

Plus de renseignements : http://www.pole-eau.com/

Vendredi 31 janvier 2014

Biomanda, membre de l'Unice Club Entrepreneur

Biomanda est membre de l'Unice Club Entrepreneur.

Plus de renseignements : http://uniceclubentrepreneurs.blogspot.fr

Lundi 16 décembre 2013

Biomanda est incubée dans l'Incubateur PACA-Est

Biomanda peut désormais profiter du dynamisme et des précieux conseils de l'Incubateur PACA-Est dans son développement. Depuis décembre 2013, notre société est accompagnée et financée par cette structure.

Plus de renseignements : www.incubateurpacaest.org

Lundi 9 décembre 2013

Biomanda participe à BiomInnov

Venez-nous rencontrer sur Paris au parc Biocitech sur le stand de notre partenaire Ceeram pour découvrir nos offres de services.

Plus de renseignements sur cet évènement : www.adebiotech.org/biominnov/

Mardi 3 décembre 2013

Biomanda participe à la soirée de la fondation Unice

Sur le site de l'université de Nice au château Valrose.

Plus de renseignements sur cet évènement : Fondation Unice

Jeudi 26 septembre 2013

Biomanda participe à Startup Factory

Jeudi 26 septembre 2013, Biomanda a participé à l'événement Startup Factory qui donne une tribune aux porteurs des nouveaux projets innovants de la région de Sophia Antipolis. Au cours de cette soirée, nous avons présenté notre projet et ses services de conception et d'amélioration de solutions de détection ainsi que d'étude de biodiversité nouvelle génération.

Lundi 16 septembre 2013

Le nouveau site internet de Biomanda

Découvrez notre nouveau site internet et nos offres de services de bioinformatique en détection et en étude de biodiversité.

Lundi 16 septembre 2013

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Lundi 15 juillet 2013

2ème prix de la Fondation Unice

Biomanda a obtenu la seconde récompense de l'appel à projets 2013 "Création / Reprise d'entreprise" de la Fondation Unice dans la catégorie "Innovation, Recherche et Développement".

Plus d'informations sur le concours...
Plus d'informations sur les résultats...